Gimnazjum nr 2 w Sejnach uczestniczy w projekcie innowacyjnym testującym realizowanym przez Centrum Edukacji Nauczycieli w Suwałkach w ramach Programu Operacyjnego Kapitał Ludzki

Celem projektu jest wdrożenie w gimnazjach innowacyjnych rozwiązań programowych i metodycznych umożliwiających uczniom wykorzystanie technologii informacyjno-komunikacyjnej, ze szczególnym uwzględnieniem jej nowoczesnych środków w procesie uczenia się przedmiotów matematycznych i przyrodniczych.